Повністю локальний конвейер GraphRAG із LangExtract, Neo4j, Qdrant та Ollama
Створіть GraphRAG на локальних моделях: витягніть ентитети за допомогою LangExtract, збережіть їх у Neo4j, індексуйте у Qdrant, а потім розширіть підграфи для отримання відповідей, заснованих на графах.
Джерела: A Practical GraphRAG Architecture Using LangExtract, Neo4j, Qdrant, and Ollama
Ця версія — це система GraphRAG, яка працює виключно з локальними моделями. До складу входять Ollama для мовних та ембеддингових моделей, Neo4j для графів, Qdrant для векторного пошуку та LangExtract для видобутку структури з тексту. Замість отримання фрагментів документів, як це робить звичайний RAG, вона перетворює необроблений текст на граф знань, знаходить елементи, семантично близькі до запиту, а потім простежує взаємозв’язки між ними.
Головною частиною цієї архітектури є LangExtract, який знаходить елементи та взаємозв’язки в неструктурованому тексті та повертає їх у форматі, придатному для зберігання в графі. Qdrant додає значення завдяки векторній схожості, а Neo4j — контекст через просування по зв’язках. Разом вони створюють потік обробки даних, який бере до уваги як зміст запиту, так і спосіб взаємозв’язку фактів.
Як працює архітектура
Сирий текст спочатку потрапляє до шару LangExtract. У звичайних підходах документи негайно діляться на частини та вбудовуються. Тут текст спочатку перетворюється на структуровані знання. LangExtract, який працює за допомогою моделі, розміщеної в Ollama, виділяє ентитети та зв’язки між ними. У прикладі використовуються дані про ліки: види препаратів, дозування, частота прийому та медичні стани витягуються, а їхні зв’язки зберігаються завдяки спільному групуванню. Природна мова стає структурованим записом фактів, а не просто набором збережених уривків тексту.
Далі вилучені ентитети та зв’язки стають частинами графу. Кожна концепція перетворюється на вузол із унікальним ID, а такі зв’язки, як дозування, частота або умови, стають прямими ребрами між вузлами. Інформація тепер організовується навколо ентитетів та їхніх зв’язків, а не навколо меж документів, що дозволяє зберегти контекст, який інакше був би втрачений під час пошуку за фрагментами.
Потім граф завантажується до Neo4j — основного сховища структурованих знань. Ентитети перетворюються на вузли, а зв’язки — на вбудовані ребра. Оскільки Neo4j може ефективно переміщуватися між пов’язаними концепціями, система здатна пізніше простежувати багатоетапні шляхи та виявляти контекст, який знаходиться за межами точки початку вилучення інформації.
Після створення графа для кожної вершини генерується вкладення. Модель вкладень читає назви ентитетів та концепції безпосередньо, а не цілі документи чи їх фрагменти. Результатом є семантичний індекс ентитетів графа, тож пошук зосереджується на концепціях, а не на уривках тексту.
Ці вектори надходять до Qdrant разом із відповідними ID вершин у Neo4j. Qdrant виконує функцію швидкого семантичного шару, тоді як Neo4j залишається структурованим шаром. Оскільки кожен пакет даних у Qdrant містить ID вершини у Neo4j, знахідка вектора безпосередньо відповідає ентитету графа. Такий підхід дозволяє кожній базі даних виконувати те, у чому вона найкраще: пошук схожості в одній, а аналіз взаємозв’язків та міркування в графі — у іншій.
Під час пошуку користувач ставить запитання мовою природного мовлення. Той самий модель ембеддингу перетворює його на вектор, який потім шукається у Qdrant для знаходження найбільш релевантних елементів графа. Замість фрагментів документів пошук повертає ідентифікатори вузлів. Ці вузли є семантичними точками входу до графа, що представляють концепції, найближчі до того, що потрібно користувачеві.
Ці ідентифікатори потім використовуються для формування запиту до Neo4j. Замість того, щоб зупинятися на знайдених елементах, система розширює пошук через сусідні вузли та зв’язки, збираючи релевантний підграф, який містить як знайдені елементи, так і їхній навколишній контекст. Таке розширення дозволяє зібрати додаткові факти, які сама схожість векторів не могла б виявити, тому контекст поєднує в собі як семантичну релевантність, так і структуру.
Потім підграф перетворюється для використання в мовній моделі. Вузли об’єднуються у структурований список, а зв’язки перетворюються на читабельні трипли, які вказують на конкретні зв’язки, наприклад «доза Лізиноприлу – 10 мг» або «Метформін при діабеті». Цей крок з’єднує бази даних графів та мовні моделі, перетворюючи структуру графа на текст, який може інтерпретувати модель.
Нарешті, сформатований контекст графа надсилається до LLM. Модель отримує ентитети та зв’язки, а не фрагменти інформації, тому вона може аналізувати наведені факти та не змушена виводити зв’язки з фрагментованих уривків. Оскільки контекст походить від просування по графу, він також є більш пояснюваним та простежуваним порівняно зі звичайним векторним пошуком.
У сукупності це гібридна система пошуку. LangExtract виконує видобуток знань, Neo4j керує структурованими взаємозв’язками, Qdrant здійснює семантичний пошук ентитетів, а LLM аналізує контекст, заснований на графах. Поєднання схожості та обробки даних шляхом просування по графі дозволяє відповідати на запитання на основі пов’язаних знань, а не окремих фрагментів тексту. Це робить цей підхід особливо ефективним у таких галузях, як охорона здоров’я, фінанси, право, управління корпоративними знаннями та наукові дослідження, де взаємозв’язки між ентитетами часто мають більше значення, ніж будь-який окремий уривок тексту.
Метод за методом
__init__() є точкою входу для всієї системи. Вона читає конфігурацію з змінних середовища, яка включає облікові дані Neo4j, деталі підключення до Qdrant та налаштування Ollama. Вона відкриває з’єднання до Neo4j та Qdrant, які використовуються рештою потоку обробки даних, а також створює клієнт Ollama, який використовується для екстракції, створення векторних представлень та синтезу відповідей. Назви моделей та розміри векторів зберігаються як параметри, що дозволяє налаштовувати систему.
def __init__(self,env_path: str = ".env",ollama_model_extract: str = "gemma3:latest",
ollama_model_answer: str = "gemma3:latest",ollama_embedding_model: str = "embeddinggemma:latest",
ollama_host: str | None = None,vector_dimension: int = 768,
):
load_dotenv(env_path)
self.qdrant_key = os.getenv("QDRANT_KEY")
self.qdrant_url = os.getenv("QDRANT_URL")
self.neo4j_uri = os.getenv("NEO4J_URI")
self.neo4j_username = os.getenv("NEO4J_USERNAME")
self.neo4j_password = os.getenv("NEO4J_PASSWORD")
self.neo4j_driver = GraphDatabase.driver(
self.neo4j_uri, auth=(self.neo4j_username, self.neo4j_password)
)
self.qdrant_client = QdrantClient(
url=self.qdrant_url,
api_key=self.qdrant_key,
)
# Ollama client for local embeddings (embeddinggemma:latest)
self.ollama_client = ollama.Client(host=ollama_host) if ollama_host else ollama.Client()
# langextract needs a plain URL string, not a client object
self.ollama_url = ollama_host or os.environ.get("OLLAMA_HOST", "http://localhost:11434")
# Model / config knobs
self.ollama_model_extract = ollama_model_extract
self.ollama_model_answer = ollama_model_answer
self.ollama_embedding_model = ollama_embedding_model
self.vector_dimension = vector_dimension
extract_graph_components() перетворює необроблений текст на структуровані знання. Він надає інструкції щодо екстракції разом із прикладами, які спрямовують LangExtract на правильні елементи та взаємозв’язки. Модель, розміщена на Ollama, потім обробляє вхідні дані та виділяє ліки, дозування, частоту застосування та стани. Результатом все ще є набір екстрагованих елементів, а не граф, тому цей метод передає їх для створення графа.
def extract_graph_components(self, raw_data: str):
"""Extract medication entities and relationships using langextract + Ollama."""
prompt_description = textwrap.dedent("""
Extract medications with their details, using attributes to group related information:
1. Extract entities in the order they appear in the text
2. Each entity must have a 'medication_group' attribute linking it to its medication
3. All details about a medication should share the same medication_group value
""").strip()
examples = [
lx.data.ExampleData(
text=(
"Patient takes Aspirin 100mg daily for heart health and"
" Simvastatin 20mg at bedtime."
),
extractions=[
lx.data.Extraction(
extraction_class="medication",
extraction_text="Aspirin",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="dosage",
extraction_text="100mg",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="frequency",
extraction_text="daily",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="condition",
extraction_text="heart health",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="medication",
extraction_text="Simvastatin",
attributes={"medication_group": "Simvastatin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="dosage",
extraction_text="20mg",
attributes={"medication_group": "Simvastatin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="frequency",
extraction_text="at bedtime",
attributes={"medication_group": "Simvastatin"},
),
],
)
]
result = lx.extract(
text_or_documents=raw_data,
prompt_description=prompt_description,
examples=examples,
model_id=self.ollama_model_extract,
model_url=self.ollama_url,
resolver_params={"format_handler": lx_ollama.OLLAMA_FORMAT_HANDLER},
max_char_buffer=4000,
show_progress=True,
)
return self._convert_extractions_to_graph(result.extractions)
_convert_extractions_to_graph() перетворює витягнуті дані у формат графа. Він об’єднує пов’язані елементи та обирає основну entитет кожної групи як вузол-анкор. Кожен вузол отримує унікальний ідентифікатор, щоб Neo4j та Qdrant залишалися сумісними. Кромки потім з’єднують анкори з їхніми атрибутами, зберігаючи первісний сенс. Результатом є набір вузлів та кромок, готовий до використання в базі даних у форматі графа.
def _convert_extractions_to_graph(self, extractions: list):
"""Convert langextract's flat, grouped extractions into (nodes, relationships)."""
groups: dict[str, list] = {}
for ext in extractions:
if not ext.attributes or "medication_group" not in ext.attributes:
continue
group_name = ext.attributes["medication_group"]
groups.setdefault(group_name, []).append(ext)
nodes: dict[str, str] = {}
relationships: list[dict] = []
for group_name, group_extractions in groups.items():
anchor_ext = next(
(e for e in group_extractions if e.extraction_class == "medication"),
None,
)
# Fall back to the group name itself if no explicit "medication"
# extraction was found in this group, so we still get an anchor.
anchor_text = anchor_ext.extraction_text if anchor_ext else group_name
if anchor_text not in nodes:
nodes[anchor_text] = str(uuid.uuid4())
for ext in group_extractions:
if ext is anchor_ext:
continue
target_text = ext.extraction_text
if target_text not in nodes:
nodes[target_text] = str(uuid.uuid4())
relationships.append(
{
"source": nodes[anchor_text],
"target": nodes[target_text],
"type": ext.extraction_class,
}
)
return nodes, relationships
ingest_to_neo4j() записує граф у Neo4j, де кожна ентитет зберігається як вузол, а кожні зв’язки — як ребро. Така структура дозволяє ефективно пересуватися та досліджувати граф у майбутньому. Кожен вузол зберігає свій унікальний ідентифікатор, що дозволяє йому поєднуватися з результатами векторного пошуку. Після завершення цього методу граф стає структурованим сховищем знань системи.
def ingest_to_neo4j(self, nodes: dict, relationships: list):
"""
Ingest nodes and relationships into Neo4j.
"""
with self.neo4j_driver.session() as session:
# Create nodes in Neo4j
for name, node_id in nodes.items():
session.run(
"CREATE (n:Entity {id: $id, name: $name})",
id=node_id,
name=name,
)
# Create relationships in Neo4j, using the semantic type
# (dosage/frequency/condition/etc.) as the actual relationship
# label instead of a generic "RELATIONSHIP" type.
for relationship in relationships:
rel_type = self._sanitize_relationship_type(relationship["type"])
session.run(
"MATCH (a:Entity {id: $source_id}), (b:Entity {id: $target_id}) "
f"CREATE (a)-[:{rel_type} {{type: $type}}]->(b)",
source_id=relationship["source"],
target_id=relationship["target"],
type=relationship["type"],
)
return nodes
_sanitize_relationship_type() існує тому, що назви взаємозв’язків походять з результатів роботи ШІ та можуть містити недійсні символи чи дивні формати. Він очищує та стандартизує позначки перед їх надсиланням до Neo4j, створюючи безпечні ідентифікатори великих літер, які відповідають правилам Cypher. Він також захищає від некоректних назв та проблем з запитами, які вони можуть спричинити. Цей метод є простим, але допомагає підтримувати стабільність графа.
@staticmethod
def _sanitize_relationship_type(raw_type: str) -> str:
"""
Cypher relationship types can't be passed as query parameters, so
they have to be interpolated into the query string directly. Since
raw_type comes from LLM-extracted text, sanitize it to a safe
UPPER_SNAKE_CASE identifier before interpolation, to avoid Cypher
injection or syntax errors from unexpected characters.
"""
safe = "".join(ch if ch.isalnum() else "_" for ch in raw_type.strip())
safe = safe.upper().strip("_") or "RELATIONSHIP"
if safe[0].isdigit():
safe = f"REL_{safe}"
return safe
create_collection() переконується, що колекція Qdrant існує перед тим, як зберігати будь-які вектори. Вона перевіряє, чи вже є колекція з заданим ім’ям, і створює її, якщо її немає, налаштовуючи розмір вектора та метрику схожості, які використовуються під час пошуку. Попередня перевірка дозволяє уникнути зайвого створення колекцій та готує шар векторів до початку завантаження даних.
def create_collection(self, collection_name: str, vector_dimension: int = None):
vector_dimension = vector_dimension or self.vector_dimension
try:
# Try to fetch the collection status
self.qdrant_client.get_collection(collection_name)
print(f"Skipping creating collection; '{collection_name}' already exists.")
except Exception as e:
# If collection does not exist, an error will be thrown, so we create the collection
if "Not found: Collection" in str(e) or "doesn't exist" in str(e) or "404" in str(e):
print(f"Collection '{collection_name}' not found. Creating it now...")
self.qdrant_client.create_collection(
collection_name=collection_name,
vectors_config=models.VectorParams(
size=vector_dimension, distance=models.Distance.COSINE
),
)
print(f"Collection '{collection_name}' created successfully.")
else:
print(f"Error while checking collection: {e}")
ollama_embeddings() генерує щільні вектори за допомогою моделі ембеддингів Ollama. Кожна графова entність та кожен запит користувача проходять через неї. Ці вектори числово передають значення, що дозволяє ефективно їх порівнювати, а це становить основу пошуку за схожістю у Qdrant. Фактично цей метод є мостом між природною мовою та пошуком за векторами.
def ollama_embeddings(self, text: str) -> list[float]:
response = self.ollama_client.embeddings(
model=self.ollama_embedding_model,
prompt=text,
)
return response["embedding"]
ingest_to_qdrant() створює ембеддинг для кожної entитету після того, як існують вузли графа, та зберігає його в Qdrant. Разом із кожним вектором зберігаються метадані — а саме ідентифікатор вузла Neo4j та назва entитету. Це прив’язування поєднує базу даних векторів із графовою базою даних, щоб результати пошуку згодом можна було перетворити назад на графові entитети. Цей метод формує шар семантичного пошуку архітектури.
def ingest_to_qdrant(self, collection_name: str, raw_data: str, node_id_mapping: dict):
names = list(node_id_mapping.keys())
embeddings = [self.ollama_embeddings(name) for name in names]
self.qdrant_client.upsert(
collection_name=collection_name,
points=[
{
"id": str(uuid.uuid4()),
"vector": embedding,
"payload": {"id": node_id_mapping[name], "name": name},
}
for name, embedding in zip(names, embeddings)
],
)
retriever_search() здійснює семантичне пошукове вилучення під час обробки запиту. Запит інтегрується та порівнюється з векторами в Qdrant. У результаті отримуються графові елементи, які схожі на запит, а не фрагменти тексту; ці елементи слугують вхідними точками до графа знань. Таким чином пошук керується концепціями, а не документами.
def retriever_search(self, collection_name: str, query: str, top_k: int = 5):
retriever = QdrantNeo4jRetriever(
driver=self.neo4j_driver,
client=self.qdrant_client,
collection_name=collection_name,
id_property_external="id",
id_property_neo4j="id",
)
results = retriever.search(
query_vector=self.ollama_embeddings(query), top_k=top_k
)
return results
fetch_related_graph() запитує Neo4j щодо оточення щойно знайдених ентитетів. Він просувається по графіку, щоб зібрати сусідні вузли та зв’язки, які пов’язують їх із отриманими ентитетами. Це розширення додає контекст, який може бути пропущений під час векторного порівняння, та створює змістовний підграф замість ізольованих ентитетів. Цей крок забезпечує можливість GraphRAG міркувати на основі зв’язків між ентитетами.
def fetch_related_graph(self, entity_ids: list):
query = """
MATCH (e:Entity)-[r1]-(n1)-[r2]-(n2)
WHERE e.id IN $entity_ids
RETURN e, r1 as r, n1 as related, r2, n2
UNION
MATCH (e:Entity)-[r]-(related)
WHERE e.id IN $entity_ids
RETURN e, r, related, null as r2, null as n2
"""
with self.neo4j_driver.session() as session:
result = session.run(query, entity_ids=entity_ids)
subgraph = []
for record in result:
subgraph.append(
{
"entity": record["e"],
"relationship": record["r"],
"related_node": record["related"],
}
)
if record["r2"] and record["n2"]:
subgraph.append(
{
"entity": record["related"],
"relationship": record["r2"],
"related_node": record["n2"],
}
)
return subgraph
format_graph_context() підготовлює підграф для моделі, адже сирі дані графа не підходять безпосередньо для використання ЛМ. Він перетворює структуру на чистий текст, що складається з вузлів та описів взаємозв’язків, записаних у зрозумілих тріплах, які пояснюють, як пов’язані елементи. Цей формат зберігає структуру графа, водночас залишаючись зрозумілим для мовної моделі. Це останній етап підготовки контексту перед наданням відповіді.
def format_graph_context(self, subgraph: list):
nodes = set()
edges = []
for entry in subgraph:
entity = entry["entity"]
related = entry["related_node"]
relationship = entry["relationship"]
nodes.add(entity["name"])
nodes.add(related["name"])
edges.append(f"{entity['name']} {relationship['type']} {related['name']}")
return {"nodes": list(nodes), "edges": edges}
graphRAG_run() генерує кінцеву відповідь. Він об’єднує сформатований контекст графа з запитанням користувача в один промпт. Модель отримує інформацію, пов’язану з графом, а не сирі фрагменти документа, тож може аналізувати зв’язки та пов’язані факти, а її відповідь ґрунтується на отриманих знаннях з графа. Це шар аналізу в кінці процесу обробки даних.
def graphRAG_run(self, graph_context: dict, user_query: str):
nodes_str = ", ".join(graph_context["nodes"])
edges_str = "; ".join(graph_context["edges"])
prompt = f"""
You are an intelligent assistant with access to the following knowledge graph:
Nodes: {nodes_str}
Edges: {edges_str}
Using this graph, Answer the following question:
User Query: "{user_query}"
"""
try:
response = chat(
model=self.ollama_model_answer,
messages=[
{
"role": "system",
"content": "Provide the answer for the following question:",
},
{"role": "user", "content": prompt},
],
)
return response.message.content
except Exception as e:
return f"Error querying LLM: {str(e)}"
create_and_ingest() координує весь процес імпорту даних: створення колекції векторів, видобуток компонентів графа, їх зберігання в Neo4j, генерація ембеддингів та індексування ентитетів у Qdrant. Його виконання перетворює необроблений текст на пошукову базу знань GraphRAG. Зазвичай він запускається один раз під час підготовки даних, після чого система може відповідати на запити.
def create_and_ingest(self, raw_data: str, query: str, collection_name: str = "medicationGraphRAGstore"):
print("Creating collection...")
self.create_collection(collection_name, self.vector_dimension)
print("Collection created/verified")
print("Extracting graph components...")
nodes, relationships = self.extract_graph_components(raw_data)
print("Nodes:", nodes)
print("Relationships:", relationships)
print("Ingesting to Neo4j...")
node_id_mapping = self.ingest_to_neo4j(nodes, relationships)
print("Neo4j ingestion complete")
print("Ingesting to Qdrant...")
self.ingest_to_qdrant(collection_name, raw_data, node_id_mapping)
print("Qdrant ingestion complete")
run_pipeline() координує процес отримання інформації та міркувань від початку до кінця. Він починається з семантичного пошуку в Qdrant, визначає відповідні елементи графу та просувається через Neo4j. Отриманий підграф форматується у вигляді контексту для моделі міркувань, а створена відповідь надсилається користувачеві. Цей процес відображає повний шлях від запитання до відповіді.
def run_pipeline(self, raw_data: str, query: str, collection_name: str = "medicationGraphRAGstore"):
# run only the first time, comment this for subsequent runs
# self.create_and_ingest(raw_data, query, collection_name)
print("Starting retriever search...")
retriever_result = self.retriever_search(collection_name, query)
print("Retriever results:", retriever_result)
print("Extracting entity IDs...")
entity_ids = [
item.content.split("'id': '")[1].split("'")[0]
for item in retriever_result.items
]
print("Entity IDs:", entity_ids)
print("Fetching related graph...")
subgraph = self.fetch_related_graph(entity_ids)
print("Subgraph:", subgraph)
print("Formatting graph context...")
graph_context = self.format_graph_context(subgraph)
print("Graph context:", graph_context)
print("Running GraphRAG...")
answer = self.graphRAG_run(graph_context, query)
print("Final Answer:", answer)
return answer
close() відповідає за очищення. Він закриває з’єднання драйвера Neo4j та звільняє пов’язані ресурси, що запобігає витокам з’єднань та дозволяє плавне завершення роботи. Цей процес простий, але його завжди слід викликати після завершення обробки.
def close(self):
self.neo4j_driver.close()
Код водія об’єднує клас:
if __name__ == "__main__":
print("Script started")
graph_rag = MedicationGraphRAG(env_path="../.env")
# Example-1
# raw_data = textwrap.dedent("""
# The patient was prescribed Lisinopril and Metformin last month.
# He takes the Lisinopril 10mg daily for hypertension, but often misses
# his Metformin 500mg dose which should be taken twice daily for diabetes.
# """).strip()
# Example-2
raw_data = textwrap.dedent("""
The patient is a 62-year-old man with a history of multiple chronic conditions
being managed through an extensive medication regimen. He was prescribed
Lisinopril, Metformin, Atorvastatin, Aspirin, Levothyroxine, and Sertraline
over the course of the past year, with his treatment plan adjusted several
times based on follow-up visits.
He takes Lisinopril 10mg daily for hypertension, but often misses his
Metformin 500mg dose which should be taken twice daily for diabetes. His
cardiologist also started him on Atorvastatin 40mg at bedtime for high
cholesterol after his last lipid panel showed elevated LDL levels. To reduce
his risk of cardiovascular events, he was additionally prescribed Aspirin
81mg daily for heart disease prevention, which he takes alongside his
breakfast each morning.
Following a routine thyroid screening, he was found to have an underactive
thyroid and was started on Levothyroxine 75mcg every morning for
hypothyroidism, to be taken on an empty stomach before any other medications.
More recently, after reporting persistent low mood and difficulty sleeping
during a wellness visit, his primary care physician added Sertraline 50mg
daily for depression, with plans to reassess the dosage after eight weeks.
Despite the number of prescriptions, the patient has had difficulty
maintaining consistency with his Metformin and occasionally forgets his
evening Atorvastatin dose, which his care team is now addressing through a
simplified pill organizer and reminder system.
""").strip()
# Sample Questions
#1. "What is the dosage and frequency for Lisinopril?"
#2. "What is the dosage and frequency for Metformin?"
#3. "Which medications does the patient take once daily versus twice daily?"
#4. "What medication is prescribed for hypothyroidism, and at what dose?"
#5. "List all medications related to cardiovascular conditions and their dosages."
#6. "How often does the patient take Aspirin?"
#7. "What condition is Levothyroxine prescribed for?"
#8. "What time of day should Levothyroxine be taken, and why?"
#9. "Which medications does the patient have trouble taking consistently?"
#10. "What is the dosage and frequency for Sertraline?"
query = "List all medications related to cardiovascular conditions and their dosages."
answer = graph_rag.run_pipeline(raw_data, query, collection_name="medicationGraphRAGstore")
graph_rag.close()
Повний сценарій
Усі елементи разом у одному файлі:
import os
import uuid
import textwrap
import ollama
from dotenv import load_dotenv, find_dotenv
from ollama import chat
from neo4j import GraphDatabase
from qdrant_client import QdrantClient, models
from neo4j_graphrag.retrievers import QdrantNeo4jRetriever
import langextract as lx
from langextract.providers import ollama as lx_ollama
load_dotenv(find_dotenv())
class MedicationGraphRAG:
def __init__(self,env_path: str = ".env",ollama_model_extract: str = "gemma3:latest",
ollama_model_answer: str = "gemma3:latest",ollama_embedding_model: str = "embeddinggemma:latest",
ollama_host: str | None = None,vector_dimension: int = 768,
):
load_dotenv(env_path)
self.qdrant_key = os.getenv("QDRANT_KEY")
self.qdrant_url = os.getenv("QDRANT_URL")
self.neo4j_uri = os.getenv("NEO4J_URI")
self.neo4j_username = os.getenv("NEO4J_USERNAME")
self.neo4j_password = os.getenv("NEO4J_PASSWORD")
self.neo4j_driver = GraphDatabase.driver(
self.neo4j_uri, auth=(self.neo4j_username, self.neo4j_password)
)
self.qdrant_client = QdrantClient(
url=self.qdrant_url,
api_key=self.qdrant_key,
)
# Ollama client for local embeddings (embeddinggemma:latest)
self.ollama_client = ollama.Client(host=ollama_host) if ollama_host else ollama.Client()
# langextract needs a plain URL string, not a client object
self.ollama_url = ollama_host or os.environ.get("OLLAMA_HOST", "http://localhost:11434")
# Model / config knobs
self.ollama_model_extract = ollama_model_extract
self.ollama_model_answer = ollama_model_answer
self.ollama_embedding_model = ollama_embedding_model
self.vector_dimension = vector_dimension
def extract_graph_components(self, raw_data: str):
"""Extract medication entities and relationships using langextract + Ollama."""
prompt_description = textwrap.dedent("""
Extract medications with their details, using attributes to group related information:
1. Extract entities in the order they appear in the text
2. Each entity must have a 'medication_group' attribute linking it to its medication
3. All details about a medication should share the same medication_group value
""").strip()
examples = [
lx.data.ExampleData(
text=(
"Patient takes Aspirin 100mg daily for heart health and"
" Simvastatin 20mg at bedtime."
),
extractions=[
lx.data.Extraction(
extraction_class="medication",
extraction_text="Aspirin",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="dosage",
extraction_text="100mg",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="frequency",
extraction_text="daily",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="condition",
extraction_text="heart health",
attributes={"medication_group": "Aspirin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="medication",
extraction_text="Simvastatin",
attributes={"medication_group": "Simvastatin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="dosage",
extraction_text="20mg",
attributes={"medication_group": "Simvastatin"},
),
lx.data.Extraction(
extraction_class="frequency",
extraction_text="at bedtime",
attributes={"medication_group": "Simvastatin"},
),
],
)
]
result = lx.extract(
text_or_documents=raw_data,
prompt_description=prompt_description,
examples=examples,
model_id=self.ollama_model_extract,
model_url=self.ollama_url,
resolver_params={"format_handler": lx_ollama.OLLAMA_FORMAT_HANDLER},
max_char_buffer=4000,
show_progress=True,
)
return self._convert_extractions_to_graph(result.extractions)
def _convert_extractions_to_graph(self, extractions: list):
"""Convert langextract's flat, grouped extractions into (nodes, relationships)."""
groups: dict[str, list] = {}
for ext in extractions:
if not ext.attributes or "medication_group" not in ext.attributes:
continue
group_name = ext.attributes["medication_group"]
groups.setdefault(group_name, []).append(ext)
nodes: dict[str, str] = {}
relationships: list[dict] = []
for group_name, group_extractions in groups.items():
anchor_ext = next(
(e for e in group_extractions if e.extraction_class == "medication"),
None,
)
# Fall back to the group name itself if no explicit "medication"
# extraction was found in this group, so we still get an anchor.
anchor_text = anchor_ext.extraction_text if anchor_ext else group_name
if anchor_text not in nodes:
nodes[anchor_text] = str(uuid.uuid4())
for ext in group_extractions:
if ext is anchor_ext:
continue
target_text = ext.extraction_text
if target_text not in nodes:
nodes[target_text] = str(uuid.uuid4())
relationships.append(
{
"source": nodes[anchor_text],
"target": nodes[target_text],
"type": ext.extraction_class,
}
)
return nodes, relationships
def ingest_to_neo4j(self, nodes: dict, relationships: list):
"""
Ingest nodes and relationships into Neo4j.
"""
with self.neo4j_driver.session() as session:
# Create nodes in Neo4j
for name, node_id in nodes.items():
session.run(
"CREATE (n:Entity {id: $id, name: $name})",
id=node_id,
name=name,
)
# Create relationships in Neo4j, using the semantic type
# (dosage/frequency/condition/etc.) as the actual relationship
# label instead of a generic "RELATIONSHIP" type.
for relationship in relationships:
rel_type = self._sanitize_relationship_type(relationship["type"])
session.run(
"MATCH (a:Entity {id: $source_id}), (b:Entity {id: $target_id}) "
f"CREATE (a)-[:{rel_type} {{type: $type}}]->(b)",
source_id=relationship["source"],
target_id=relationship["target"],
type=relationship["type"],
)
return nodes
@staticmethod
def _sanitize_relationship_type(raw_type: str) -> str:
"""
Cypher relationship types can't be passed as query parameters, so
they have to be interpolated into the query string directly. Since
raw_type comes from LLM-extracted text, sanitize it to a safe
UPPER_SNAKE_CASE identifier before interpolation, to avoid Cypher
injection or syntax errors from unexpected characters.
"""
safe = "".join(ch if ch.isalnum() else "_" for ch in raw_type.strip())
safe = safe.upper().strip("_") or "RELATIONSHIP"
if safe[0].isdigit():
safe = f"REL_{safe}"
return safe
def create_collection(self, collection_name: str, vector_dimension: int = None):
vector_dimension = vector_dimension or self.vector_dimension
try:
# Try to fetch the collection status
self.qdrant_client.get_collection(collection_name)
print(f"Skipping creating collection; '{collection_name}' already exists.")
except Exception as e:
# If collection does not exist, an error will be thrown, so we create the collection
if "Not found: Collection" in str(e) or "doesn't exist" in str(e) or "404" in str(e):
print(f"Collection '{collection_name}' not found. Creating it now...")
self.qdrant_client.create_collection(
collection_name=collection_name,
vectors_config=models.VectorParams(
size=vector_dimension, distance=models.Distance.COSINE
),
)
print(f"Collection '{collection_name}' created successfully.")
else:
print(f"Error while checking collection: {e}")
def ollama_embeddings(self, text: str) -> list[float]:
response = self.ollama_client.embeddings(
model=self.ollama_embedding_model,
prompt=text,
)
return response["embedding"]
def ingest_to_qdrant(self, collection_name: str, raw_data: str, node_id_mapping: dict):
names = list(node_id_mapping.keys())
embeddings = [self.ollama_embeddings(name) for name in names]
self.qdrant_client.upsert(
collection_name=collection_name,
points=[
{
"id": str(uuid.uuid4()),
"vector": embedding,
"payload": {"id": node_id_mapping[name], "name": name},
}
for name, embedding in zip(names, embeddings)
],
)
def retriever_search(self, collection_name: str, query: str, top_k: int = 5):
retriever = QdrantNeo4jRetriever(
driver=self.neo4j_driver,
client=self.qdrant_client,
collection_name=collection_name,
id_property_external="id",
id_property_neo4j="id",
)
results = retriever.search(
query_vector=self.ollama_embeddings(query), top_k=top_k
)
return results
def fetch_related_graph(self, entity_ids: list):
query = """
MATCH (e:Entity)-[r1]-(n1)-[r2]-(n2)
WHERE e.id IN $entity_ids
RETURN e, r1 as r, n1 as related, r2, n2
UNION
MATCH (e:Entity)-[r]-(related)
WHERE e.id IN $entity_ids
RETURN e, r, related, null as r2, null as n2
"""
with self.neo4j_driver.session() as session:
result = session.run(query, entity_ids=entity_ids)
subgraph = []
for record in result:
subgraph.append(
{
"entity": record["e"],
"relationship": record["r"],
"related_node": record["related"],
}
)
if record["r2"] and record["n2"]:
subgraph.append(
{
"entity": record["related"],
"relationship": record["r2"],
"related_node": record["n2"],
}
)
return subgraph
def format_graph_context(self, subgraph: list):
nodes = set()
edges = []
for entry in subgraph:
entity = entry["entity"]
related = entry["related_node"]
relationship = entry["relationship"]
nodes.add(entity["name"])
nodes.add(related["name"])
edges.append(f"{entity['name']} {relationship['type']} {related['name']}")
return {"nodes": list(nodes), "edges": edges}
def graphRAG_run(self, graph_context: dict, user_query: str):
nodes_str = ", ".join(graph_context["nodes"])
edges_str = "; ".join(graph_context["edges"])
prompt = f"""
You are an intelligent assistant with access to the following knowledge graph:
Nodes: {nodes_str}
Edges: {edges_str}
Using this graph, Answer the following question:
User Query: "{user_query}"
"""
try:
response = chat(
model=self.ollama_model_answer,
messages=[
{
"role": "system",
"content": "Provide the answer for the following question:",
},
{"role": "user", "content": prompt},
],
)
return response.message.content
except Exception as e:
return f"Error querying LLM: {str(e)}"
def create_and_ingest(self, raw_data: str, query: str, collection_name: str = "medicationGraphRAGstore"):
print("Creating collection...")
self.create_collection(collection_name, self.vector_dimension)
print("Collection created/verified")
print("Extracting graph components...")
nodes, relationships = self.extract_graph_components(raw_data)
print("Nodes:", nodes)
print("Relationships:", relationships)
print("Ingesting to Neo4j...")
node_id_mapping = self.ingest_to_neo4j(nodes, relationships)
print("Neo4j ingestion complete")
print("Ingesting to Qdrant...")
self.ingest_to_qdrant(collection_name, raw_data, node_id_mapping)
print("Qdrant ingestion complete")
def run_pipeline(self, raw_data: str, query: str, collection_name: str = "medicationGraphRAGstore"):
# run only the first time, comment this for subsequent runs
# self.create_and_ingest(raw_data, query, collection_name)
print("Starting retriever search...")
retriever_result = self.retriever_search(collection_name, query)
print("Retriever results:", retriever_result)
print("Extracting entity IDs...")
entity_ids = [
item.content.split("'id': '")[1].split("'")[0]
for item in retriever_result.items
]
print("Entity IDs:", entity_ids)
print("Fetching related graph...")
subgraph = self.fetch_related_graph(entity_ids)
print("Subgraph:", subgraph)
print("Formatting graph context...")
graph_context = self.format_graph_context(subgraph)
print("Graph context:", graph_context)
print("Running GraphRAG...")
answer = self.graphRAG_run(graph_context, query)
print("Final Answer:", answer)
return answer
def close(self):
self.neo4j_driver.close()
if __name__ == "__main__":
print("Script started")
graph_rag = MedicationGraphRAG(env_path="../.env")
# Example-1
# raw_data = textwrap.dedent("""
# The patient was prescribed Lisinopril and Metformin last month.
# He takes the Lisinopril 10mg daily for hypertension, but often misses
# his Metformin 500mg dose which should be taken twice daily for diabetes.
# """).strip()
# Example-2
raw_data = textwrap.dedent("""
The patient is a 62-year-old man with a history of multiple chronic conditions
being managed through an extensive medication regimen. He was prescribed
Lisinopril, Metformin, Atorvastatin, Aspirin, Levothyroxine, and Sertraline
over the course of the past year, with his treatment plan adjusted several
times based on follow-up visits.
He takes Lisinopril 10mg daily for hypertension, but often misses his
Metformin 500mg dose which should be taken twice daily for diabetes. His
cardiologist also started him on Atorvastatin 40mg at bedtime for high
cholesterol after his last lipid panel showed elevated LDL levels. To reduce
his risk of cardiovascular events, he was additionally prescribed Aspirin
81mg daily for heart disease prevention, which he takes alongside his
breakfast each morning.
Following a routine thyroid screening, he was found to have an underactive
thyroid and was started on Levothyroxine 75mcg every morning for
hypothyroidism, to be taken on an empty stomach before any other medications.
More recently, after reporting persistent low mood and difficulty sleeping
during a wellness visit, his primary care physician added Sertraline 50mg
daily for depression, with plans to reassess the dosage after eight weeks.
Despite the number of prescriptions, the patient has had difficulty
maintaining consistency with his Metformin and occasionally forgets his
evening Atorvastatin dose, which his care team is now addressing through a
simplified pill organizer and reminder system.
""").strip()
# Sample Questions
#1. "What is the dosage and frequency for Lisinopril?"
#2. "What is the dosage and frequency for Metformin?"
#3. "Which medications does the patient take once daily versus twice daily?"
#4. "What medication is prescribed for hypothyroidism, and at what dose?"
#5. "List all medications related to cardiovascular conditions and their dosages."
#6. "How often does the patient take Aspirin?"
#7. "What condition is Levothyroxine prescribed for?"
#8. "What time of day should Levothyroxine be taken, and why?"
#9. "Which medications does the patient have trouble taking consistently?"
#10. "What is the dosage and frequency for Sertraline?"
query = "List all medications related to cardiovascular conditions and their dosages."
answer = graph_rag.run_pipeline(raw_data, query, collection_name="medicationGraphRAGstore")
graph_rag.close()
Запуск
Три зразкові запитання демонструють роботу системи. Кожне з них виводить результати пошуку, а потім відповідь, засновану на графіці.
query = "List all medications related to cardiovascular conditions and their dosages."
Console:
Starting retriever search...
Retriever results: items=[RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}> score=0.5062605>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}> score=0.47961158>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}> score=0.45777896>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}> score=0.45199984>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}> score=0.4511963>", metadata=None)] metadata={'__retriever': 'QdrantNeo4jRetriever'}
Extracting entity IDs...
Entity IDs: ['1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419', '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182', '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21', '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56', '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb']
Fetching related graph...
Subgraph: [{'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:3' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '81mg', 'id': '9d1d3859-cf6f-4a22-81b8-7d80e3cc8e89'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '81mg', 'id': '9d1d3859-cf6f-4a22-81b8-7d80e3cc8e89'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:2' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:3' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'high cholesterol', 'id': 'dc85b413-3eca-4f26-a1dd-95de9d61e46c'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:3' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'high cholesterol', 'id': 'dc85b413-3eca-4f26-a1dd-95de9d61e46c'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:1' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:2' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'at bedtime', 'id': 'f9a049d4-bdb9-443d-a70f-3aa0ad290f5d'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:2' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'at bedtime', 'id': 'f9a049d4-bdb9-443d-a70f-3aa0ad290f5d'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:0' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Atorvastatin', 'id': '1db81626-c3de-4cab-b5dd-091327785182'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:1' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '40mg', 'id': '960fd15d-ad36-4b90-aede-3473dd53f70c'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:1' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '40mg', 'id': '960fd15d-ad36-4b90-aede-3473dd53f70c'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypertension', 'id': '1bc0479e-5e00-4ede-8a9d-704e56f58814'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypertension', 'id': '1bc0479e-5e00-4ede-8a9d-704e56f58814'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}]
Formatting graph context...
Graph context: {'nodes': ['on an empty stomach before any other medications', 'hypertension', 'Atorvastatin', 'Lisinopril', 'Levothyroxine', 'at bedtime', 'high cholesterol', 'Aspirin', '75mcg', '81mg', 'daily', '10mg', 'heart disease prevention', 'every morning', 'Sertraline', 'hypothyroidism', '40mg'], 'edges': ['heart disease prevention condition Aspirin', 'Aspirin frequency daily', 'heart disease prevention condition Aspirin', 'Aspirin dosage 81mg', 'Lisinopril frequency daily', 'daily frequency Sertraline', 'Lisinopril frequency daily', 'daily frequency Aspirin', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine condition hypothyroidism', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine frequency every morning', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine dosage 75mcg', 'Atorvastatin condition high cholesterol', 'Atorvastatin frequency at bedtime', 'Atorvastatin dosage 40mg', 'heart disease prevention condition Aspirin', 'Levothyroxine route on an empty stomach before any other medications', 'Levothyroxine condition hypothyroidism', 'Levothyroxine frequency every morning', 'Levothyroxine dosage 75mcg', 'Lisinopril condition hypertension', 'Lisinopril frequency daily', 'Lisinopril dosage 10mg', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine']}
Running GraphRAG...
Final Answer: Here’s a list of medications related to cardiovascular conditions and their dosages based on the knowledge graph:
* **Aspirin:** 81mg (frequency: daily) - for heart disease prevention.
* **Atorvastatin:** 40mg (frequency: at bedtime) - for high cholesterol.
* **Lisinopril:** 10mg (frequency: daily) - for hypertension.
query = "What medication is prescribed for hypothyroidism, and at what dose?"
Console:
Starting retriever search...
Retriever results: items=[RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}> score=0.6616618>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}> score=0.5983002>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}> score=0.4675771>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}> score=0.4620626>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}> score=0.4382253>", metadata=None)] metadata={'__retriever': 'QdrantNeo4jRetriever'}
Extracting entity IDs...
Entity IDs: ['95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05', '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb', 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847', '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419', 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797']
Fetching related graph...
Subgraph: [{'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypertension', 'id': '1bc0479e-5e00-4ede-8a9d-704e56f58814'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypertension', 'id': '1bc0479e-5e00-4ede-8a9d-704e56f58814'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}]
Formatting graph context...
Graph context: {'nodes': ['Lisinopril', '75mcg', 'twice daily', 'diabetes', 'on an empty stomach before any other medications', 'hypertension', 'daily', 'Metformin', '500mg', '10mg', 'hypothyroidism', 'Levothyroxine', 'every morning'], 'edges': ['10mg dosage Lisinopril', 'Lisinopril condition hypertension', '10mg dosage Lisinopril', 'Lisinopril frequency daily', 'hypothyroidism condition Levothyroxine', 'Levothyroxine route on an empty stomach before any other medications', 'hypothyroidism condition Levothyroxine', 'Levothyroxine frequency every morning', 'hypothyroidism condition Levothyroxine', 'Levothyroxine dosage 75mcg', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine condition hypothyroidism', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine frequency every morning', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine dosage 75mcg', 'Levothyroxine route on an empty stomach before any other medications', 'Levothyroxine condition hypothyroidism', 'Levothyroxine frequency every morning', 'Levothyroxine dosage 75mcg', '10mg dosage Lisinopril', 'Metformin condition diabetes', 'Metformin frequency twice daily', 'Metformin dosage 500mg', 'hypothyroidism condition Levothyroxine', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine']}
Running GraphRAG...
Final Answer: Levothyroxine 75mcg is prescribed for hypothyroidism, taken every morning.
query = "Which medications does the patient take once daily versus twice daily?"
Console:
Starting retriever search...
Retriever results: items=[RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}> score=0.6052238>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}> score=0.50138044>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}> score=0.424541>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}> score=0.42364278>", metadata=None), RetrieverResultItem(content="<Record node=<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}> score=0.4210245>", metadata=None)] metadata={'__retriever': 'QdrantNeo4jRetriever'}
Extracting entity IDs...
Entity IDs: ['73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa', '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419', '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058', '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd', 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847']
Fetching related graph...
Subgraph: [{'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:22' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'depression', 'id': '3aca7091-a4fa-4b12-ba5a-a8dbbbac5df4'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:22' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'depression', 'id': '3aca7091-a4fa-4b12-ba5a-a8dbbbac5df4'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:21' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '50mg', 'id': '5fe00dee-bd0f-4476-b5a6-b19974033f78'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:21' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '50mg', 'id': '5fe00dee-bd0f-4476-b5a6-b19974033f78'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'heart disease prevention', 'id': '44573186-869f-4d5d-ba04-fe254ec4ed21'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:3' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '81mg', 'id': '9d1d3859-cf6f-4a22-81b8-7d80e3cc8e89'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:5' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '81mg', 'id': '9d1d3859-cf6f-4a22-81b8-7d80e3cc8e89'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypertension', 'id': '1bc0479e-5e00-4ede-8a9d-704e56f58814'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypertension', 'id': '1bc0479e-5e00-4ede-8a9d-704e56f58814'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:6' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '10mg', 'id': 'cddff401-0958-4093-b196-ad270b7aa797'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:18' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'hypothyroidism', 'id': '95b91440-5ff1-41eb-a036-b57880094b05'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'every morning', 'id': '7fb1c7e5-e414-43ec-8606-474b08dc9173'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:16' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '75mcg', 'id': '75b6f7a1-2f53-419c-9365-5f026dcb1e25'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:17' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:20' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Sertraline', 'id': '42844c4c-ce96-4bd9-8d37-d8adad5a75fe'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:4' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Aspirin', 'id': '10939c85-6fc1-41b4-9b80-abe1662eda11'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'daily', 'id': '06da6faa-baa5-4657-a961-5091f58e3058'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:8' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Lisinopril', 'id': '04f27c55-38a3-46a9-a411-4faf07836a56'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:9' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>) type='DOSAGE' properties={'type': 'dosage'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:13' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': '500mg', 'id': '6c38fe32-0ca3-4bcc-a072-05e302aaa8e7'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:10' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:14' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'twice daily', 'id': '73d5a502-05be-4bb7-916a-10b8ff5130fa'}>) type='FREQUENCY' properties={'type': 'frequency'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:11' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'diabetes', 'id': '9cbb512f-ca6b-47de-bb12-378ac35826bd'}>) type='CONDITION' properties={'type': 'condition'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:12' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Metformin', 'id': 'd14d70ef-3780-4ebe-b803-1ab8bd8ec847'}>}, {'entity': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>, 'relationship': <Relationship element_id='5:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:15' nodes=(<Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>, <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:19' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'on an empty stomach before any other medications', 'id': '1c9fb28e-c3e1-4515-afa0-01939beac419'}>) type='ROUTE' properties={'type': 'route'}>, 'related_node': <Node element_id='4:a53f7783-1308-4f3d-9a27-45cede6b6376:7' labels=frozenset({'Entity'}) properties={'name': 'Levothyroxine', 'id': '60654f2d-2ec8-4f4e-be02-cd57b7c5abfb'}>}]
Formatting graph context...
Graph context: {'nodes': ['twice daily', 'daily', '75mcg', '50mg', '81mg', 'Aspirin', 'on an empty stomach before any other medications', 'hypothyroidism', 'hypertension', 'depression', 'Lisinopril', 'Levothyroxine', 'heart disease prevention', 'every morning', 'Sertraline', 'diabetes', '500mg', '10mg', 'Metformin'], 'edges': ['daily frequency Sertraline', 'Sertraline condition depression', 'daily frequency Sertraline', 'Sertraline dosage 50mg', 'daily frequency Aspirin', 'Aspirin condition heart disease prevention', 'daily frequency Aspirin', 'Aspirin dosage 81mg', 'daily frequency Lisinopril', 'Lisinopril condition hypertension', 'daily frequency Lisinopril', 'Lisinopril dosage 10mg', 'twice daily frequency Metformin', 'Metformin condition diabetes', 'twice daily frequency Metformin', 'Metformin dosage 500mg', 'diabetes condition Metformin', 'Metformin frequency twice daily', 'diabetes condition Metformin', 'Metformin dosage 500mg', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine condition hypothyroidism', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine frequency every morning', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine', 'Levothyroxine dosage 75mcg', 'daily frequency Sertraline', 'daily frequency Aspirin', 'daily frequency Lisinopril', 'Metformin condition diabetes', 'Metformin frequency twice daily', 'Metformin dosage 500mg', 'twice daily frequency Metformin', 'diabetes condition Metformin', 'on an empty stomach before any other medications route Levothyroxine']}
Running GraphRAG...
Final Answer: Here’s the breakdown of medications taken once daily versus twice daily based on the knowledge graph:
**Once Daily:**
* Aspirin: daily frequency
* Sertraline: daily frequency
* Levothyroxine: every morning frequency
**Twice Daily:**
* Metformin: twice daily frequency
Що показує процес будування
Результатом є повний пайплайн GraphRAG, у якому кожен компонент працює локально на Ollama, Neo4j, Qdrant та LangExtract. Неструктурований текст перетворюється на структуровані знання шляхом вилучення елементів та взаємозв’язків, а ці знання зберігаються у вигляді графу в Neo4j. Qdrant забезпечує семантичне пошукове функціонування серед елементів графу та поєднує векторний пошук із перебіром шляхів у графі. Разом вони замінюють пошук на основі фрагментів на пошук, зорієнтований на контекст та ґрунтований у взаємопов’язаних знаннях, що дозволяє ШІ міркувати на основі взаємозв’язків, а не окремих фрагментів тексту, що призводить до більш обґрунтованих та легкозрозумілих відповідей. Оскільки вся інфраструктура є локальною, розробники зберігають повний контроль над своїми даними, моделями та інфраструктурою. У міру зростання популярності GraphRAG такий підхід є практичним планом для пошуку, зорієнтованого на взаємозв’язки, створеного за допомогою інструментів відкритого коду.